謝って大切なファイルを削除してしまいました。
Redmineのデータ移行で、バックアップしたデータベースを新しい環境にインポートする際にリダイレクションを逆向きにしてしまうというイージーミスによる上書きでした。
mysql -u root -p??? redmine < redmine.dump
としなければならないところを誤って
mysql -u root -p??? redmine > redmine.dump
としてしまった結果です。最近ではクラウド上のデータにはスナップショット機能があったり、MacにはそもそもTime Machineがあったりとデータを失う機会はあまりないですが、運悪く何の保護もされていないデータでした。
復旧用のソフトをいくつか試し、いくらかの時間とお金を使ってなんとか復旧できました。